Act I
Muzikál začíná shrnutím dětství Alexandra Hamiltona v polovině 18. století, před americkou revolucí. Různí členové souboru popisují, jak řada nešťastných náhod nastartovala Hamiltona na jeho cestu ke slávě. Poté, co hurikán zničil jeho ostrov, matka zemřela a otec ho opustil, Hamilton o svých traumatických zážitcích píše. Lidé z jeho ostrova, ohromeni jeho jazykovou vybaveností, vybrali peníze, aby ho poslali do Ameriky získat vzdělání. Poté, co se diváci seznámí s touto expozicí, začíná vlastní hra.
Po příjezdu do New Yorku vyhledá ambiciózní mladý Hamilton Aarona Burra a požádá ho o radu, jak získat urychlené studium, jako to udělal Burr. Burr Hamiltonovi radí, aby tolik nemluvil, ale Hamilton trvá na tom, že tolik mluví, protože má vášnivé názory. Obě postavy jsou vytvořeny jako protipóly jedna pro druhou; tam, kde je Hamilton drzý, otevřený a názorově vyhraněný, je Burr opatrný, strategický a méně zásadový. Když se oba noví známí vydají do baru, setkají se s Johnem Laurensem, Herculesem Mulliganem a markýzem de Lafayette. Všichni kromě Burra jsou nadšeni blížící se americkou revolucí a jásají: “Pozvedněte sklenku na svobodu.”
Dále se seznamujeme se sestrami Schuylerovými, které se potulují centrem New Yorku a užívají si vzrušení z měnících se společenských vln. Aaron Burr balí Angeliku, ale ta ho odmítá. Poté prohlásí, že četla Common Sense Thomase Paina a hledá “zjevení”, čímž vyjadřuje touhu po rovnoprávnosti žen.
Setkáváme se s loajalistou Samuelem Seaburym, farmářem, který odsuzuje revoluční Kontinentální kongres (a všechny vlastence obecně). Když se Hamilton s farmářem setká, kritizuje Seaburyho odsouzení. Do Ameriky dorazí zpráva od krále Jiřího, která varuje kolonisty, že král udělá vše, co bude muset, aby udržel kolonie pod svou kontrolou. Král vyšle generála Howea a 30 000 vojáků do newyorského přístavu, čímž zpochybňuje touhu koloniálních Američanů po nezávislosti.
Dále se seznamujeme s generálem Georgem Washingtonem, který si uvědomuje, že kolonisté jsou proti britským vojskům v těžké nevýhodě. Je frustrován tím, že povstalecká vojska stále ustupují. Když Hamilton ukradne anglickým vojákům děla a ukáže, že je ochoten riskovat a porušovat pravidla v zájmu Ameriky, získá si Washingtonovu přízeň. Mezitím se Aaron Burr představí Washingtonovi a nabídne mu pomoc a radu, ale nakonec Washingtona urazí tím, že kritizuje současný stav koloniálních vojsk. Washington požádá Hamiltona, aby mu pomohl s válečnými plány, a Hamilton naverbuje na pomoc povstání Johna Laurense, Herkula Mulligana a Lafayetta. Mulligana nastrčí na britskou stranu jako špiona a napíše dopis Kongresu, aby ho přesvědčil o zaslání zásob. Chce využít momentu překvapení a porazit Brity.
O něco později jsou Aaron Burr a Alexander Hamilton na zimním plese a Burr Hamiltonovi říká, že když si vezme sestru Schuylerovou, zbohatne. Eliza Schuylerová Hamiltona spatří a na první pohled se do něj zamiluje. Řekne své sestře Angelice, že Hamilton je ten pravý, a tak je Angelika seznámí. Alexander a Eliza si následující dva týdny píší milostné dopisy a pak se zasnoubí.
V den svatby Angelika divákům prozradí, že je také zamilovaná do Alexandra, ale dala ho Elize, protože byl chudý a od ní se očekávalo, že si vezme bohatého, a protože věděla, že Eliza je do něj zamilovaná. Když Hamiltonovi přátelé blahopřejí Hamiltonovi ke svatbě, ptají se Burra na ženu, kterou má “bokem”. Burr přiznává, že miluje ženu jménem Theodosia, která je provdaná za britského důstojníka. Hamilton mu říká, aby za ní šel, ale Burr říká, že je “ochoten na ni počkat”. Burr srovnává svůj život s Hamiltonovým a poznamenává, že “Hamiltona čeká nekonečné stoupání do kopce” a že “neztrácí čas”, ale Burr počká, až zjistí, jaký je jeho vlastní záměr, než začne jednat.
Později se americkým vojákům nebezpečně nedostává zásob. Washington plánuje překvapivý noční útok proti Britům a doufá v pomoc Francouzů. Washington jmenuje Charlese Leeho druhým velitelem, ale Lee se ukáže jako neschopný vést armádu. Když Lee kritizuje Washingtona, Laurens vyzve Leeho na souboj, přestože to Washington zakázal. V souboji Laurens střelí Leeho do boku, a tak se Lee vzdá. Washington je naštvaný na Hamiltona, který působil jako Laurensova dvojka. Když Hamilton trvá na tom, že by měl velet praporu, Washington s tím nesouhlasí s tím, že je to příliš riskantní a že potřebuje Hamiltona, aby zůstal naživu, a pošle ho domů.
Když Hamilton přijede domů, Eliza mu řekne, že je těhotná a že napsala Washingtonovi, aby Hamiltona poslal domů. Lafayette mezitím zajistí pomoc z Francie a zajistí, že kolonisté budou schopni porazit Brity u Yorktownu. Washington pozve Hamiltona zpět a nabídne mu místo velitele.
1781-Bitva u Yorktownu. Hamilton, který se obává možnosti zbloudilého, náhodného výstřelu, nařizuje svým mužům, aby při překvapivém útoku odstranili náboje ze svých zbraní. Po týdnu bojů se Britové vzdávají. Král Jiří se vrací na scénu, aby zopakoval své varování, a vyzývá Ameriku: “Co bude dál?”. Říká jim, že neumějí vést a být nezávislí.
Aaron Burr, který se oženil se ženou, s níž měl poměr po smrti jejího manžela, se setkává se svým prvním a jediným dítětem, dcerou jménem Theodosia. Současně se Hamilton setkává se svým synem Filipem. Oba noví rodiče mají podobnou naději, že se jim podaří vybudovat zemi, do níž jejich dítě “dospěje”. Oba se vracejí do New Yorku studovat práva, ale Hamilton postupuje mnohem dál a rychleji než Burr, stává se právníkem a pracuje na vůbec prvním procesu s vrahem v nezávislé Americe. Vzhledem ke svému nadání je Hamilton vybrán k účasti na Ústavodárném konventu, skupině, která má za úkol vytvořit právní rámec nového státu. Uprostřed noci se objeví v Burrově domě a požádá ho, zda by mu nepomohl s obhajobou nové ústavy, a přizná, že Burr je lepší právník než on. Když Burr odmítne pomoci se sepsáním Federalistických spisů, Alexander mu vyčte, že nikdy nemá vlastní názor a vždy stojí stranou. Později Hamilton naverbuje Johna Jaye a Jamese Madisona, aby mu pomohli Papíry napsat. Washington požádá Hamiltona, aby vedl Národní ministerstvo financí. Angelika řekne Alexandrovi, že se provdala za bohatého muže a nějaký čas s ním tráví v Londýně.
Druhé dějství
Setkáváme se s Thomasem Jeffersonem, který byl po dobu války velvyslancem ve Francii, v zahraničí. Vrací se do svého domu v Monticellu, na plantáž ve Virginii. Washington ho požádal, aby se stal ministrem zahraničí, a v době jeho návratu je již schválen Senátem. Odjíždí do New Yorku, kde ho James Madison žádá, aby pomohl zastavit Hamiltonův finanční plán, který by podle něj umožnil příliš velkou kontrolu vlády. Hamilton chce, aby federální vláda “převzala státní dluhy a založila národní banku”. Jefferson a Hamilton o tomto plánu diskutují. Jefferson argumentuje tím, že když už některé státy, například Virginie, zaplatily své válečné dluhy, neměly by platit i za dluhy jiných států. Poukazuje také na to, že vzhledem k tomu, že Amerika právě unikla vládě s příliš mnoha daněmi, nedává smysl, aby v Americe chtěli zavést federální daně. Hamilton odpovídá, že převzetí dluhů by Ameriku v dlouhodobém horizontu učinilo bohatší, a poté odsuzuje Jeffersona za podporu otrocké práce na Jihu. Washington říká Hamiltonovi, že musí najít kompromis a získat větší souhlas Kongresu, jinak bude s největší pravděpodobností požádán, aby opustil Washingtonův kabinet.
Eliza prosí Hamiltona, aby si od práce odpočinul. Ona a Angelika odjíždějí na léto do státu a chtějí, aby se k nim připojil, ale Hamilton trvá na tom, že s nimi nemůže jet na dovolenou, protože potřebuje prosadit svůj plán v Kongresu.
Když Eliza a Angelika na léto odjedou, Hamilton se setká s Marií Reynoldsovou, která se na Hamiltona obrací s prosbou o pomoc a tvrdí, že s ní její manžel James Reynolds špatně zachází. Alexander jí půjčí peníze a doprovodí ji domů. Když se Hamiltonovi nabídne, začnou spolu mít měsíc trvající milostný poměr. Brzy poté Hamilton obdrží dopis od Mariina manžela, který ho vydírá. Hamilton zaplatí Jamesi Reynoldsovi, aby o poměru nikomu (zejména Elize) neříkal.
Později se Hamilton, Jefferson a Washington sejdou na soukromé schůzce, aby projednali Hamiltonův finanční plán. Jefferson a Washington s plánem souhlasí, pokud bude hlavní město státu, které se v té době nacházelo v New Yorku, přesunuto jižněji (na sever od Virginie, do dnešního Washingtonu). Aaron Burr lituje, že nebyl v místnosti, když k dohodě došlo. James Madison, který spolupracoval s Jeffersonem, získává hlasy, které Hamilton potřebuje k prosazení dohody v Kongresu.
Aaron Burr poráží v senátním klání Elizina otce Philipa Schuylera a kvůli vítězství přechází k Demokratické republikánské straně. Hamilton považuje Burrovu kandidaturu proti Schuylerovi za osobní útok, ale Burr trvá na tom, že pouze využil příležitosti k rozvoji své kariéry.
Kongres debatuje o tom, zda pomoci francouzským občanům v jejich revoluční válce. Jefferson argumentuje tím, že Francie poskytla pomoc během americké revoluce a Amerika přislíbila pomoc Francii. Svůj argument rozvíjí tím, že Francie nežádala o půdu, pouze o pomoc s jejich revolucí. Hamilton oponuje, že Francie je po prožití vlastní revoluce příliš rozvrácená, takže její zapojení by mohlo Ameriku poškodit. Argumentuje také tím, že Amerika přijala pomoc od krále, který je nyní mrtvý, a podepsala s ním smlouvu. Washington souhlasí s Hamiltonem, že obyvatelé Francie nevědí, kdo je po revoluci povede, a proto je situace příliš nebezpečná. Jefferson obviňuje Hamiltona ze zrady Lafayetta. Burr, Jefferson a Madison jsou naštvaní, že Hamilton “strčil Washingtona do kapsy”. Všichni tři se dohodnou, že se pokusí najít na Hamiltona nějakou špínu tím, že budou sledovat peníze do státní pokladny a z ní, aby zjistili, kam mizí.
Washington sdělí Hamiltonovi, že Jefferson odstoupil z vlády, aby mohl kandidovat na prezidenta, a že Washington odstoupí. Prezidentský úřad však získá John Adams a Hamiltona okamžitě vyhodí. Hamilton zveřejní odpověď, v níž Adamse kritizuje. Mezitím Burr, Jefferson a Madison objeví Hamiltonovy platby Jamesi Reynoldsovi, které jsou podle nich důkazem jakési nezákonné politické dohody. Hamilton mužům dokazuje, že peníze státní pokladny neutratil a že platil, aby zakryl sexuální skandál. V obavách, co by s touto informací mohli jeho odpůrci udělat, vydává “Reynoldsův pamflet”, v němž se k aféře veřejně přiznává. Angelika konfrontuje Alexandra kvůli pamfletu a řekne mu, že stojí za Elizou. Když se to dozví, Eliza spálí dopisy, které Hamiltonovi napsala, aby si zachovala soukromí a vypsala se z historického “vyprávění”.
Později Hamiltonův syn Philip brání svého otce před kritikou jiného mladíka, George Eackera. Filip vyzve Eackera na souboj a Hamilton svému synovi poradí, aby vystřelil do vzduchu, až přijde čas. Při souboji začne Philip dělat, co mu otec řekl, ale Eacker vystřelí dřív, než napočítá do deseti, a zasáhne Philipa přímo nad bok. Eliza i Alexander jsou po Filipově boku, když v nemocnici umírá. Po tragédii se oba usmíří.
Volby roku 1800. Američané jsou zklamáni Adamsovým prezidentstvím. Jefferson i Burr kandidují proti němu. Protože je jasné, že Adams prezidentem nebude, soupeří Jefferson a Burr. Madison navrhuje, aby se Jefferson pokusil získat podporu Hamiltona. Burr vede otevřenou kampaň proti Jeffersonovi, což je v té době něco neslýchaného. Když přijde čas, federalistická strana se podívá na Hamiltona, aby zjistila, jakým způsobem by měla hlasovat. Hamilton podpoří Jeffersona a prohlásí: “Jefferson má přesvědčení, Burr nemá žádné.” Hamilton se rozhodne pro Jeffersona. Rozrušený Burr vyzve Hamiltona na souboj.
Při souboji je Burr paranoidní, že ho Hamilton chce zabít. Poznamenává, že Hamilton “si metodicky pohrával se spouští” a měl na sobě brýle, “aby mohl smrtelně zamířit”. Přestože Hamilton namíří svou zbraň na oblohu přesně tak, jak to řekl svému synovi, Burr ho zastřelí. V monologu Hamilton uvažuje o odkazu, který po sobě zanechává, a o své blížící se smrti. Burr lituje, že Hamiltona zabil, a říká, že “svět byl dost široký pro Hamiltona i pro mě”. Eliza i Angelika jsou po Hamiltonově boku, když umírá.
Muzikál končí vyprávěním Elizy o otcích zakladatelích. Vypráví, jak žije o 50 let déle než Hamilton a pracuje na udržení jeho odkazu. Otevře sirotčinec jeho jménem a zpívá píseň “Kdo žije, kdo umírá, kdo vypráví tvůj příběh”
.