Srovnání centrálních nervových systémů (CNS) obratlovců a jejich bezobratlých příbuzných chordátů, hlavonožců (amfioků) a pláštěnců umožnilo nahlédnout do vývoje CNS obratlovců. Mikroanatomie a genová exprese naznačují, že nervová soustava předků chordátů byla pravděpodobně podobná nervové soustavě moderních amfioxů. O evolučním původu CNS chordátů však nepanuje shoda. Je sporné, zda společný předek Ambulacraria (ostnokožců a hemichordátů) a chordátů měl CNS s mozkem, nervové provazce jako u hemichordátů nebo nervovou síť. Pokud měl tento předek podélný CNS s mozkem, ztratil ho u ostnokožců, u nichž se nezávisle vyvinulo pět radiálních nervů. Aby se tato otázka ještě více zamotala, mají hemichordáti dva nervové provazce, které mají málo neuronů a postrádají mozek. Ačkoli konzervovaná genová exprese u plžů a dvoukřídlých naznačuje, že nervová síť je předkem CNS, o tom, zda předkové dvoukřídlých měli nervovou síť nebo nervový provazec (provazy) s odděleným mozkem, se stále vedou vášnivé diskuse.

.