Mezinárodní asociace Montessori je jedinou organizací Montessori, kterou založila sama Montessori. Byla založena v srpnu 1929 Marií a jejím synem Mariem v dánském Helsingoru v době, kdy snášela rostoucí nepřátelství v souvislosti s nástupem fašismu v Německu, Itálii a Španělsku. V roce 1936 Montessoriová přestěhovala svou rodinu z Barcelony, kde žila od roku 1917, do Larenu v Nizozemsku a kancelář AMI do prostor na Michelangelostraat v Amsterdamu.

Na začátku druhé světové války byla Montessoriová se svým synem Mariem na přednáškovém turné po Indii a jako italští občané byli až do konce války drženi v domácím vězení, respektive v internaci. Ada Piersonová, budoucí Mariova manželka, udržovala AMI v Amsterdamu během válečných let až do Mariova návratu v roce 1947. Těsně před svým návratem do Amsterdamu v roce 1947 pro ni byl zakoupen dům na adrese Koninginneweg 161 jako její domov a kancelář AMI. Její pracovna v domě se dochovala jako malé muzeum. V poválečném období se Maria Montessori obzvláště aktivně podílela na založení UNESCO a bezprostředně po svém návratu do Evropy v roce 1947 vystoupila před nově založenou organizací s projevem na téma “Výchova a mír”. Její poslední veřejné vystoupení se uskutečnilo v Londýně v roce 1951, kdy se zúčastnila 9. mezinárodního kongresu AMI.

6. května 1952 Montessori zemřela a své dědictví v AMI odkázala synovi Mariovi. AMI byla následně 24. ledna 1954 nizozemským královským dekretem zaregistrována v Nizozemsku jako Internationale Montessori Vereniging (Mezinárodní asociace Montessori).

Mario Montessori si po Mariině smrti v roce 1952 udržel funkci generálního ředitele AMI až do své smrti v roce 1982. Jeho nástupkyní se stala Ada Montessori Piersonová, která se ujala funkce generální tajemnice AMI až do své smrti v roce 1988, poté tuto funkci v organizaci převzala Fahmida Maliková.

V době svého působení ve funkci generálního ředitele AMI jmenoval Mario Montessori v roce 1958 Nancy McCormick Rambuschovou, aby zastupovala AMI v USA. Rambuschová pak v září 1960 založila Americkou Montessori společnost.

V roce 1973, v den 75. narozenin Maria Montessoriho, byl na jeho počest založen Fond Maria Montessoriho 75 (MM75 Fund) jako nezisková nadace s cílem napomáhat financování odborného vzdělávání v oblasti Montessori pedagogiky. Fond spravuje AMI.