Hangajské hory jsou největším ze tří hlavních pohoří. Táhne se v délce 800 kilometrů od západu k východu. Krajina pohoří Khangai se liší od krajiny pohoří Altaj. Zatímco v mongolském Altaji i v Altaji Gobi převládají vysoké skalnaté útesy a hluboké kotliny, Khangajské pohoří se vyznačuje širokými, pokřivenými kopulovitými horami porostlými trávou a stromy. Oblast zahrnuje několik přírodních zón včetně horské a horské stepní zóny, sibiřské tajgy a lesa. Úrodná půda a četné řeky, potoky a jezera podporují rozmanitost rostlin a oblast je životním prostředím pro obrovské množství živočišných druhů.
Podél hřebene Changajského pohoří probíhá velké rozvodí, které odděluje vody stékající do oceánů a do vnitrozemských pánví. Největší mongolská řeka Selenge se svým hlavním přítokem Orchonem odvádí vodu na sever k ruským hranicím a do jezera Bajkal. Řeky tekoucí po hřebeni pohoří Khangai jsou prudké a peřeje na řekách mají za následek malebné vodopády, jako je vodopád Orkhon s výškou 20 metrů, místně známý jako Ulaan Tsutgalan.
Třetím horským blokem je pohoří Khentii, které je menší a nižší než pohoří Altaj a Khangai. Pohoří Khentii začíná východně od Ulánbátaru a táhne se až k velkým východním pláním. Nachází se zde několik vrcholů, které se tyčí nad 2500 m n. m., přičemž nejvyšší z nich je Asralt Chajrchán, který si zachovává stopy dávného horského ledovce. Pohoří Khentii pokrývají lesy, mokřady, vysokohorská tundra a trvalá sněhová a ledová pole; jádro této odlehlé divoké oblasti je zcela neobydlené.