Konsolidierung der portugiesischen Kontrolle
Bis zu den 1880er Jahren kontrollierten die Portugiesen den Handel und erhoben Tribut in den Küstenenklaven von Ibo im Norden bis Lourenço Marques im Süden, aber ihre Fähigkeit, die Ereignisse außerhalb dieser Gebiete zu kontrollieren, war recht begrenzt; diese Situation sollte sich jedoch ändern. Da die Nachbarn des Gazastaates regelmäßig überfallen wurden, weil sie sich weigerten, Tribut zu zahlen, verbündeten sie sich zunehmend mit den Portugiesen, was die Portugiesen sowohl förderten als auch ausnutzten. In den 1890er Jahren marschierte eine Koalition aus portugiesischen Truppen und afrikanischen Armeen gegen den Staat. Als die Gaza-Führung 1897 endgültig besiegt wurde, ging der Süden Mosambiks in portugiesische Hand über. Zwei Jahrzehnte später kontrollierten die Portugiesen, die bis dahin Dutzende von Militärkampagnen durchgeführt hatten, direkt die Barue in Zentralmosambik, die afrikanischen Portugiesen in den Prazos von Sambesi und Maganja da Costa, die Yao von Mataka, die nördlichen Makua-Häuptlinge und die nördlichen Küstenscheichtümer von Angoche.
Der Handel mit Elfenbein, Gold, Sklaven, Kautschuk, Ölsaaten und einer breiten Palette europäischer Waren setzte sich im 19. Das wirtschaftliche Interesse und der Einfluss Europas in der Region änderten sich jedoch bis zur Mitte des Jahrhunderts rapide, als Reaktion auf die Entwicklungen in Afrika und Europa. Nach der Entdeckung von Diamanten (in Kimberley in den 1860er Jahren) und Gold (am Witwatersrand in den 1880er Jahren) wurden afrikanische Arbeitskräfte auf den Zuckerplantagen und in den südafrikanischen Häfen und Minen benötigt. Aufgrund des Bedarfs an Arbeitskräften waren die Europäer entschlossen, auf Kosten der afrikanischen Führung eine größere Kontrolle über Landstriche und deren Bewohner zu erlangen. Der kombinierte Kampf um den Zugang zu mineralhaltigem Land und um die Arbeitskräfte, die es bearbeiten sollten, schürte den so genannten “Scramble” im südlichen Afrika.
Portugal beanspruchte ein Gebiet vom heutigen Mosambik bis Angola. Obwohl die Deutschen, deren Gebiet im Norden an Mosambik grenzte, die portugiesischen Ansprüche akzeptierten und damit die Nordgrenze Mosambiks festlegten, widersprachen die britischen Ansprüche auf die Region denen Portugals, was zu langwierigen Verhandlungen führte. Die portugiesische Krone war jedoch bei den britischen Geldgebern hoch verschuldet, und das kleine Land war dem britischen Militär nicht gewachsen; 1891 war Portugal gezwungen, die britische Festlegung der westlichen und südlichen Grenzen Mosambiks zu akzeptieren.
Portugal hatte wenig Hoffnung, die gesamte Region auf eigene Faust zu erschließen, und wandte sich daher der vertrauten kolonialen Strategie zu, große Landstriche an private Unternehmen zu verpachten. Die gecharterten Unternehmen erhielten das Privileg, das Land und die Menschen in bestimmten Gebieten auszubeuten, und verpflichteten sich im Gegenzug, die Landwirtschaft, die Kommunikation, die sozialen Dienste und den Handel zu entwickeln. Die Mozambique Company, die Niassa Company und die Zambezia Company wurden alle in den 1890er Jahren auf diese Weise gegründet. Jegliche wirtschaftliche Entwicklung und Investitionen in die Infrastruktur standen in direktem Zusammenhang mit den Interessen der Unternehmen und erfolgten in der Regel auf Kosten der Afrikaner. Zucker-, Kopra- und Sisalplantagen, die größtenteils von zwangsverpflichteten Arbeitskräften abhingen, und Eisenbahnen, die Beira mit dem Gebiet der British South Africa Company und dem britischen Njasaland im Westen und Nordwesten verbanden, wurden zu hohen Kosten für die afrikanischen Arbeitskräfte entwickelt und gebaut.
Die portugiesische Regierung kündigte schließlich die Charter der großen Konzessionsgesellschaften und brachte ganz Mosambik unter direkte portugiesische Herrschaft. Zwischen den 1890er und den 1930er Jahren war die portugiesische Herrschaft in Mosambik durch die Ausbeutung der afrikanischen Bevölkerung und der Ressourcen durch private Parteien gekennzeichnet, seien es ausländische Firmenaktionäre oder koloniale Bürokraten und Siedler. Die schlimmsten kolonialen Missbräuche – Zwangsarbeit, Zwangsanbau, hohe Steuern, niedrige Löhne, Konfiszierung der vielversprechendsten Ländereien – traten unabhängig davon auf, welche Gruppe von Europäern die Kontrolle ausübte.