Les acides aminés ont toujours été un sujet important en biochimie et en maladies métaboliques à l’école de médecine. Qu’il s’agisse des examens de l’école de médecine où la classification des acides aminés est une longue question typique ou qu’il s’agisse des examens d’entrée comme NEET-PG, AIIMS, USMLE où des questions directes à une ligne sont posées de façon répétée, année après année.
Ce qui rend les choses difficiles, c’est qu’il y a 20 acides aminés trouvés chez les humains, et tous partagent différents groupes et propriétés. Il est difficile de se souvenir des propriétés et des groupes de classification, simplement parce qu’il y a tant à apprendre.
Heureusement, nous avons des moyens mnémotechniques et des aides à la mémoire à notre secours.
Dans cet article, nous allons énumérer tous les moyens mnémotechniques standard pour vous aider à vous souvenir des acides aminés et de leurs propriétés.
Nous allons également énumérer les faits communs qui sont demandés sur ce sujet dans NEET-PG et USMLE.
Une fois que vous avez appris tous les mnémotechniques, ne vérifier le petit quiz et de vous tester.
- Bases
- Acides aminés essentiels et non essentiels
- Polarité
- Classification structurelle des acides aminés
- Acides aminés glucogènes et cétogènes
- Une-liners sur les acides aminés
- Glycine
- Histidine
- Glutamine
- Phénylalanine et Tyrosine
- Cystéine
- Méthionine
- Glutathion
- Tryptophane
- Arginine
- Alanine
- Haut rendement.Faits saillants sur les acides aminés
Bases
Pour comprendre les bases, il faut d’abord savoir que les acides aminés sont des molécules contenant :
- Un groupe amino (-NH2)
- Un groupe acide carboxylique (-COOH)
- Une chaîne latérale qui varie entre les différents acides aminés
Notez que le groupe amino est basique et que -COOH est acide.
Si cela prête à confusion, CAAB est le mnémonique que vous devez retenir (Prononcé CAB)
Carboxyl Acidique – Amino Basique.
Acides aminés essentiels et non essentiels
La question la plus couramment posée à l’USMLE et au NEET sur ce sujet ressemble à ceci
Tous les acides aminés sont essentiels sauf :-
Maintenant il est facile de répondre si vous vous souvenez du mnémonique AV HILL MPTT
A – Arginine
V – Valine
H – Histidine
I – Isoleucine
L. – Leucine
L – Lysine
M – Méthionine
P – Phénylalanine
T – Thréonine
T – Tryptophane
Notez que parmi ces 10 – AH ! ( Prononcé ah !) c’est-à-dire l’Arginine et l’Histidine sont Semi-essentielles (car elles peuvent être synthétisées chez les adultes, mais pas chez les enfants). Les 8 autres énumérés ci-dessus sont purement essentiels – car ils ne peuvent pas être synthétisés par l’organisme et doivent être apportés par l’alimentation.
Rappelons-nous les 10 acides aminés essentiels par le mnémonique AV HILL MPTT et il est facile de se rappeler que les 10 autres sont non essentiels.
Polarité
Les acides aminés peuvent être classés en quatre groupes en fonction de leur polarité
1) Polaire avec un groupe -R positif (basique)
2) Polaire avec un groupe -R négatif (acide)
3) Polaire avec un groupe -R neutre
4) Non polaire
Une question courante sur ce sujet est Lequel d’entre eux est un acide aminé polaire ?
Utilisez ces moyens mnémotechniques pour vous rappeler la classification.
Souvenez-vous de BASIC HAL – Basic AA ie Polar with Positive -R group includes Histidine, Arginine and Lysine.
Acidic AA are easy to rememberber as Aspartate is also called Aspartic acid and glutamate is also called glutamic acid.
The third group ie Polar with Neutral -R group is a bit tricky to remember.
Utiliser STY (Serine, Thréonine, Tyrosine), CNQ (Cystéine, Aspargine, Glutamine) pour se souvenir des AA polaires avec un groupe -R neutre.
Tous les autres acides aminés non énumérés ici sont non polaires.
Classification structurelle des acides aminés
1. Chaînes latérales aliphatiques : GAVLI
- Glycine,
- Alanine,
- Valine,
- Leucine,
- Isoleucine
2. Avec groupe OH : STT (Pronoune OH S*TT)
- Sérine,
- Thréonine,
- Tyrosine
3. acide : AAGG
- Aspartate,
- Aspargine,
- Glutamate,
- Glutamine
4. contenant du soufre : CM
- Cystéine,
- Méthionine
5. Basique : HAL
- Histidine,
- Arginine,
- Lysine
6. aromatique : PTT
- Tryptophane,
Tyrosine,
Phénylalanine
7. Imide:
- Proline
Acides aminés glucogènes et cétogènes
Les acides aminés sont soit glucogènes, soit cétogènes, soit les deux.
14 acides aminés sont glucogènes c’est-à-dire qu’ils peuvent être convertis en glucose.
Les acides aminés cétogènes sont la Leucine et la Lysine (mnémonique Keto LL). Ils peuvent être convertis en corps cétoniques.
Quatre acides aminés sont à la fois glucogènes et cétogènes.
Ce sont l’Isoleucine et les 3 autres acides aminés aromatiques (Tyrosine, Tryptophane, Phénylalanine). Retenez donc que les Iso-Aromatiques (Isoleucine + 3 AA aromatiques) sont à la fois cétogènes et glucogènes.
Une-liners sur les acides aminés
Glycine
- Acide aminé le plus petit et le plus simple
- Responsable de la flexibilité de la protéine
- Optiquement inactif
- Plus de chiralité (chiralité des mains)
- La glycine avec l’arginine et la méthionine (GAM + Ornithine) synthétise la créatinine.
- La glycine (avec le succinyl CoA) sert à la synthèse de l’Hème.
Histidine
- Acide aminé le plus stable au pH physiologique
- Peut servir de meilleur tampon à pH 7
- Peut protoner et déprotoner à pH neutre
- Précurseur de l’histamine
Glutamine
- .
- Forme de stockage et de transport de l’ammoniac
- Élimination de l’ammoniac du cerveau
- Précurseur des purines et des pyrimidines
Phénylalanine et Tyrosine
- Phénylalanine est un précurseur de la tyrosine
- Tyrosine est un précurseur de :
- Catécholamines
- Thyroxine
- Mélanine
Cystéine
- Peut être synthétisée dans l’organisme à partir de la méthionine (les deux contiennent du soufre)
- Responsable de l’action réductrice du glutathion
Méthionine
- Forme S-adénosyl méthionine (SAM) qui est un important donneur de groupe méthyle dans l’organisme
Glutathion
- Antioxydant (la propriété réductrice est due au groupe sulfhydryle de la cystéine) – détoxifie H2O2 par la glutathion peroxydase
- Carrier dans le transport. de certains acides aminés à travers la membrane du rein
- Réaction de conjugaison
Tryptophane
- Précurseur de la niacine et de la sérotonine (qui forment la mélatonine)
- 60 mg de tryptophane forment 1 mg de niacine
- Aussi connu sous le nom d’alpha-amino bêta-3 indole propionique
Arginine
- Acide aminé le plus basique
- Précurseur de l’oxyde nitrique
Alanine
- Forme de transport de l’ammoniac du muscle
Haut rendement.Faits saillants sur les acides aminés
- Tous les acides aminés trouvés dans les protéines existent sous la forme L
- Les acides aminés ont 2 isomères c’est-à-dire les formes D et L. Comme chaque acide aminé a un carbone chiral.
Souvenez-vous des exceptions : La glycine n’a pas de carbone chiral, donc pas d’activité optique et pas d’isomères.
L’isoleucine et la thréonine ont 2 carbones chiraux chacun, donc quatre isomères optiques chacun. - L’absorption maximale de la lumière est montrée par le tryptophane.
Notez que seuls les AA aromatiques absorbent la lumière. - L’acide aminé le plus grand – Tryptophane
L’acide aminé le plus petit – Glycine - L’acide aminé le plus acide – Aspartate
L’acide aminé le plus basique – Arginine - L’acide aminé le plus polaire – Glutamine
L’acide aminé le moins polaire – Phénylalanal
.polaire – Phénylalanine - Acide aminé avec le groupe Imino – Proline
Acide aminé avec le groupe Indole – Tryptophane
Acide aminé avec le groupe Guanidium – Arginine - Le 21ème acide aminé est la Sélénocystéine.
Il est codé par le codon UGA (habituellement c’est un codon stop). - Le 22ème acide aminé est la Pyrolysine
Il est codé par UAG (habituellement c’est aussi un codon stop).
(Ok, voici un mot sur les codons stop – UAG, UGA et UAA sont les trois codons stop. mais, UAG code parfois pour la sélénocystéine et UGA pour la pyrolysine. Donc UAA est considéré comme le seul vrai codon stop.)
C’est tout ce que nous avons pour vous sur les mnémoniques et les infos à haut rendement sur les acides aminés.
Nous posterons bientôt un petit quiz sur les acides aminés, basé sur les mnémoniques partagés ici.