Dans cette enquête, nous avons analysé les changements dans les occurrences et les abondances relatives des espèces de poissons à travers l’Atlantique tropical et équatorial, ainsi que leurs modèles de distribution verticale en relation avec les différents scénarios environnementaux. L’étude couvre une large région englobant différentes masses d’eau, et des différences marquées de productivité, d’une zone oligotrophe proche de la côte brésilienne, à une région d’upwelling très productive proche de l’upwelling nord-ouest africain. Les poissons ont été collectés avec un chalut pélagique de taille moyenne (Mesopelagos), complété par des traits effectués avec un filet à macrozooplancton (MOCNESS). La richesse des espèces dans la région était plus élevée que dans les régions subtropicales, tempérées et froides. Le nombre total d’espèces et leur abondance globale étaient plus faibles dans les stations proches de la côte brésilienne. Les espèces abondantes dans toute la région étaient les gonostomatides Cyclothone alba, Cyclothone acclinidens, Cyclothone pallida et Cyclothone pseudopallida, le myctophile Lampanyctus alatus, le sternoptyque Sternoptyx diaphana et le phosichtyque Vinciguerria nimbaria. Les occurrences et les abondances de C. parapallida, Lampanyctus nobilis et Lepidophanes guentheri étaient liées aux zones où les eaux de l’AAIW occupaient les couches mésopélagiques, tandis que d’autres espèces telles que Cyclothone livida et Polyipnus polli augmentaient leur abondance lorsque l’AAIW disparaissait de leurs profondeurs de vie. La présence de l’Eastern North Atlantic Central Water (ENACW) a été associée à l’occurrence de plusieurs myctophidés (Benthosema glaciale, Ceratoscopelus maderensis, Diaphus holti, Diaphus rafinesquii, Hygophum hygomii, Lampanyctus crocodilus, Myctophum punctatum, Symbolophorus veranyi), et du gonostomatide Cyclothone braueri. Malgré les différences importantes dans les caractéristiques hydrographiques de l’Atlantique tropical et équatorial, toutes les stations ont montré soit la migration nocturne générale dans les couches épipélagiques effectuée par les myctophidés, les phosicthyidés et certains stomiidés, soit la présence de plusieurs espèces de Cyclothone, de sternoptychidés et de mélamphéidés qui restent dans les couches mésopélagiques, de jour comme de nuit. La zone de minimum d’oxygène (OMZ) aux profondeurs mésopélagiques dans le secteur nord-est ne semble pas perturber la migration verticale diurne. Les distributions jour-nuit de notre étude ont prouvé que les espèces migratrices mésopélagiques sont capables de traverser ces larges couches hypoxiques, et que certaines espèces comme Diaphus vanhoeffeni restent dans ces couches pendant la journée. D’autres poissons non migrateurs (Cyclothone spp. et S. diaphana) se sont révélés largement tolérants à ces faibles concentrations en oxygène, comme le montrent leurs abondances numériques élevées dans l’OMZ.