Az ínygyulladás kezeléséhez hasonlóan a megfelelő szájhigiénia az alapja a hosszú távú optimális eredmények biztosításának.
A kezelés megkezdése előtt egy vizsgálati vizitet szervezünk, ahol egy parodontogram segítségével rögzítjük az egyes fogak körüli csontveszteséget, és egy sor röntgenfelvételt készítünk, amelyek segítenek a helyes diagnózis felállításában és a páciens kezelésének megtervezésében. Bizonyos esetekben mikrobiológiai vizsgálatot is végzünk a szájban található baktériumokról. Az általunk rögzített információk között szerepel az is, hogy a páciens hogyan mossa a fogait, és jelentős időt fordítunk arra, hogy megtanítsuk neki, hogyan moshat hatékonyabban fogat. A nyilvántartás vezetésének célja, hogy láthassuk, hogyan alakul a parodontális higiénia és a zsebek állapota a kezelést követően. A higiéniai technikában elért eredmények megszilárdítása érdekében minden egyes látogatás alkalmával megerősítjük az utasításokat.
A kezelés első része az ínyhatár alatt található fogkő eltávolításából áll kuretták és ultrahang segítségével, amit gyökérkőeltávolításnak és gyökértervezésnek nevezünk (“alapfázis”). Ezt a kezelést érzéstelenítésben végzik, és nem okozhat kellemetlenséget a páciensnek sem az eljárás alatt, sem utána. Körülbelül másfél hónappal az alapfázis után újraértékelést végzünk, hogy elemezzük a kezelésre adott választ. Ha a gyökérkőeltávolítási és tervezési fázis során sikerült eltávolítanunk az ínyvonal alatti fogkövet, és a páciensnek nincsenek mély parodontális zsebei vagy vérzése, akkor a páciens áttérhet a fenntartási fázisra, a fenntartásra általában hathavonta kerül sor. Ha az újraértékelés során kiderül, hogy a páciensnek még mindig van jelen mély fogkő (ez általában akkor fordul elő, ha a fogkő az alapfázis előtt 5-6 mm mélyen van), akkor a gyökér legmélyebb részének megtisztítása érdekében indokolt lehet az ínyvonal megemelésére irányuló műtét. Bizonyos esetekben a csontdefektusok aljára különböző termékek alkalmazásával regenerálhatjuk az elvesztett csontot. A műtétet szintén altatásban végezzük, és általában nem okoz nagy kellemetlenséget vagy gyulladást. Miután ezeket a területeket a műtét révén ellenőrzés alá vontuk, a páciens átmehet a periodontális fenntartási fázisba.