La publicación ha sufrido varios cambios a lo largo de su historia. La publicación inicial en 1906 se tituló American Quarterly of Roentgenology, y se asoció oficialmente a la ARRS en 1909. En 1913, la revista pasó a llamarse American Journal of Roentgenology, y la frecuencia de publicación pasó a ser mensual bajo la dirección de Preston M. Hickey. Hickey seguiría siendo el editor jefe durante aproximadamente 10 años, y se convirtió en una voz pionera para la evolución de la educación y los informes radiológicos. Con la llegada de la radioterapia y la medicina nuclear bajo los auspicios de la radiología, hubo un período desde 1920 hasta la década de 1970 durante el cual la ARRS comenzó a publicar artículos sobre temas de radiooncología y medicina nuclear, además de radiología de diagnóstico. En consecuencia, la revista pasó a llamarse American Journal of Roentgenology and Radium Therapy en 1922, y posteriormente American Journal of Roentgenology, Radium Therapy, and Nuclear Medicine. Finalmente, en 1976, la revista volvió a llamarse American Journal of Roentgenology, momento en el que se implantó la revisión por pares obligatoria.

En 1975, el presidente del comité de publicación, Raymond Gagliardi, y el editor jefe, Melvin Figley, fundaron The American Journal of Neuroradiology junto con la American Society of Neuroradiology.