Aminosyrer har altid været et vigtigt emne inden for biokemi og metaboliske sygdomme på medicinstudiet. Det være sig eksamener på medicinske skoler, hvor klassificering af aminosyrer er et typisk langt spørgsmål, eller det være sig PG optagelsesprøver som NEET-PG, AIIMS, USMLE, hvor der år efter år gentagne gange bliver spurgt om direkte one-liners.
Det, der gør sagen svær, er, at der findes 20 aminosyrer i mennesker, og alle deler forskellige grupper og egenskaber. Det er svært at huske egenskaberne og klassifikationsgrupperne, simpelthen fordi der er så meget at lære.
Godt nok har vi mnemoteknikker og hukommelseshjælpemidler til vores redning.
I denne artikel vil vi opremse alle de standard mnemoteknikker, der hjælper dig med at huske aminosyrer og deres egenskaber.
Vi vil også opregne de almindelige fakta, der bliver spurgt om dette emne i NEET-PG og USMLE.
Når du har lært alle mnemomikkerne, kan du tjekke den korte quiz og teste dig selv.

Grundlæggende

For at forstå det grundlæggende skal du først og fremmest vide, at Aminosyrer er molekyler, der indeholder:

1. En aminogruppe (-NH2)
2. En carboxylsyregruppe (-COOH)
3. En sidekæde, der varierer mellem forskellige aminosyrer

Bemærk, at aminogruppen er basisk, og -COOH er sur.
Hvis det er forvirrende, er CAAB den mnemoteknik, du skal huske (Pronomen CAB)
Carboxyl Acidic – Amino Basic.

Essentielle og ikke-essentielle aminosyrer

Det hyppigst stillede spørgsmål i USMLE og NEET om dette emne lyder nogenlunde sådan her
Alle er essentielle aminosyrer undtagen :-

Nu er det let at svare, hvis man husker huskesedlen AV HILL MPTT

A – Arginin
V – Valin
H – Histidin
I – Isoleucin
L – Leucin
L – Lysin
M – Methionin
P – Phenylalanin
T – Threonin
T – Tryptofan

Bemærk, at af disse 10 – AH! ( Prononceret ah!) dvs. Arginin og Histidin er Semi-essentielle (da de kan syntetiseres hos voksne, men ikke hos børn). De 8 andre opregnet ovenfor er rent essentielle – da disse ikke kan syntetiseres af kroppen og skal tilføres via kosten.
Husk de 10 essentielle aminosyrer ved hjælp af huskesedlen AV HILL MPTT, og det er let at huske, at de 10 andre er ikke-essentielle.

Polaritet

Aminosyrer kan klassificeres i fire grupper baseret på polaritet
1) Polære med positiv -R-gruppe (basisk)
2) Polære med negativ -R-gruppe (surt)
3) Polære med neutral -R-gruppe
4) Ikke-polære
Et almindeligt spørgsmål om dette emne er: Hvilken af disse er en polær aminosyre?
Brug disse mnemoteknikker til at huske klassifikationen.
Husk BASIC HAL – Basic AA dvs. polær med positiv -R gruppe omfatter Histidin, Arginin og Lysin.
Acidic AA er nemme at huske, da Aspartat også kaldes Aspartic acid og glutamat også kaldes glutaminsyre.
Den tredje gruppe dvs. polær med neutral -R gruppe er lidt vanskelig at huske.
Brug STY (Serine, Threonine, Tyrosine), CNQ (Cystein, Aspargine, Glutamine) til at huske de polære AA med neutral -R gruppe.
Alle andre aminosyrer, der ikke er nævnt her, er upolære.

Strukturel klassificering af aminosyrer

1. Alifatiske sidekæder: GAVLI

• Glycin,
• Alanin,
• Valin,
• Leucin,
• Isoleucin

2. Med OH-gruppe: STT (Pronoune OH S*TT)

• Serin,
• Threonin,
• Tyrosin

3. Syreholdige: AAGG

• Aspartat,
• Aspargin,
• Glutamat,
• Glutamin

4. Svovlholdige: CM

• Cystein,
• Methionin

5. Basisk: HAL

• Histidin,
• Arginin,
• Lysin

6. Aromatisk: PTT

• Tryptofan,
  Tyrosin,
  Phenylalanin

7. Imid:

• Prolin

Glucogene og ketogene aminosyrer

Aminosyrer er enten glucogene eller ketogene eller begge dele.

14 aminosyrer er glucogene dvs. kan omdannes til glukose.
Ketogene aminosyrer er leucin og lysin (Mnemoteknik Keto LL). De kan omdannes til ketonstoffer.
Fire aminosyrer er både glucogene og ketogene.
Disse er Isoleucin og andre 3 aromatiske aminosyrer (Tyrosin, Tryptofan, Phenylalanin). Så husk, at Iso-Aromatic (Isoleucine + 3 aromatiske AA) er både ketogene og glucogene.

En-liners om aminosyrer

Glycin

• Smindste og enkleste aminosyre
• Ansvarlig for fleksibilitet i protein
• Optisk inaktiv
• Mangler chiralitet (handedness)
• Glycin med arginin og methionin (GAM + Ornithin) syntetiserer kreatinin.
• Glycin (med succinyl CoA) anvendes til Hæm-syntese.

Histidin

• Mest stabile aminosyre ved fysiologisk pH
• Kan fungere som bedste buffer ved pH 7
• Kan protonere og deprotonere ved neutral pH
• Formidler af histamin

Glutamin

• Lagrings- og transportform af ammoniak
• Fjernelse af ammoniak fra hjernen
• Forløber for puriner og pyrimidiner

Phenylalanin og Tyrosin

• Phenylalanin er forløber for tyrosin
• Tyrosin er en forløber for:
  • Catecholaminer
  • Thyroxin
  • Melanin

Cystein

• Kan syntetiseres i kroppen fra methionin (begge indeholder svovl)
• Er ansvarlig for den reducerende virkning af glutathion

Methionin

• Formerer S-adenosylmethionin (SAM), som er en vigtig methylgruppedonor i kroppen

Glutathion

• Antioxidant (reducerende egenskab skyldes cystein sulfhydrylgruppe) – afgifter H2O2 ved hjælp af glutathionperoxidase
• Bærer i transport af visse aminosyrer over membranen i nyren
• Konjugationsreaktion

Tryptofan

• Forløber for niacin og serotonin (som danner melatonin)
• 60 mg tryptofan danner 1 mg niacin
• Også kendt som alpha-amino beta-3 indolpropionsyre

Arginin

• Mest basisk aminosyre
• Forstadie til nitrogenoxid

Alanin

• Transportform af ammoniak fra muskler

Høj-Udbytte fakta om Aminosyrer

1. Alle aminosyrer, der findes i proteiner, findes i L-form
2. Aminosyrer har 2 isomerer dvs. D- og L-former. Da hver aminosyre har ét chiralt kulstof.
   Husk de undtagelser : Glycin har ikke noget chiralt kulstof, så ingen optisk aktivitet og ingen isomerer.
   Isoleucin og Threonin har 2 chirale kulstoffer hver, så fire optiske isomerer hver.
3. Maximal absorption af lys vises af Tryptofan.
   Bemærk, at kun aromatiske AA absorberer lys.
4. Største aminosyre- Tryptofan
   Mindste aminosyre- Glycin
5. Mest syreholdige aminosyre- Aspartat
   Mest basiske aminosyre – Arginin
6. Mest polære aminosyre – Glutamin
   Mest ikke-polær aminosyre – Phenylalanin
7. Aminosyre med Imino-gruppe – Prolin
   Aminosyre med Indol-gruppe – Tryptofan
   Aminosyre med Guanidium-gruppe – Arginin
8. 21. aminosyre er Selenocystein.
   Den er kodet af codon UGA (normalt er det et stopcodon).
9. 22. aminosyre er Pyrolysin
   Den er kodet af UAG (normalt er det også et stopcodon).

(Ok, her er et ord om stopkodoner – UAG, UGA og UAA er de tre stopkodoner. men, UAG koder nogle gange for Selenocystein og UGA koder nogle gange for pyrolysin. Så UAA betragtes som den eneste sande stopkodon.)

Det er alt, hvad vi har til dig om mnemoteknik og højtydende info om aminosyrer.
Vi vil snart sende en kort quiz om aminosyrer, baseret på de mnemoteknikker, der er delt her.