Blodgrupper eller blodtyper er defineret ved polymorfismer i udtrykket af immunogene molekyler i blodceller, plasma og kropssekretioner som mælk og spyt. En række af disse kan findes på tværs af arter, herunder hos mennesker og menneskeaber. Der er flere forskellige kategorier af blodgruppeantigener beskrevet hos mennesker, som har stor klinisk betydning. De mest almindeligt beskrevne af disse, på grund af deres høje polymorfisme i menneskelige populationer og kliniske relevans, er ABO-blodgrupperne og Rhesus (Rh)-faktoren.

Det menneskelige ABO-blodgruppesystem har stor betydning for transfusion og transplantation og er med få undtagelser fortsat polymorft i de fleste menneskelige populationer. Disse antigener er oligosakkarider, der syntetiseres af glykosyltransferaseenzymer, som skaber et mønster af sukkerstoffer, der findes på cellernes ydre membran eller udskilt glycoprotien. I blodtype O er der en kulhydratsekvens, der kaldes H-antigenet, til stede. Personer af type A og B ændrer H-antigenet ved at tilføje et yderligere monosaccharid for at fremstille tilsvarende A- og B-antigener. Individer producerer antistoffer mod de antigener, der ikke findes i deres eget blod. Denne proces formodes at ske ved tidlig eksponering for bakterier med lignende antigener. Tilstedeværelsen af ABO-polymorfisme er meget variabel hos alle primater. Indtil videre er det konstateret, at chimpanser primært har blodtype A, mens blodtype O er mere sjældent forekommende. Gorillaer synes udelukkende at have blodtype B. Orangutanger har alle tre blodtyper.

I modsætning til ABO-blodgruppen er Rh-blodgruppens antigener proteiner. Rh-typen er vigtig hos mennesker på grund af dens rolle i forbindelse med hæmolytisk sygdom hos den nyfødte, hvor antistofferne hos en Rh-kvinde (som mangler D-antigenproteinet i Rh-blodgruppen) retter sig mod D-antigenet på de røde blodlegemer hos et Rh+-foster. Rh-polymorfismer findes også hos chimpanser, hvor de oprindeligt blev beskrevet i R-C-E-F-blodgruppesystemet. Chimpanser deler nogle af varianterne af Rh med mennesker, men de to arter har yderligere varianter, som de ikke deler. Forhåndsimmunisering af chimpanser med D-antigen kan forårsage hæmolytisk sygdom hos den nyfødte i efterfølgende graviditeter; det er dog ikke dokumenteret, at dette forekommer naturligt.

Andre, mindre almindeligt undersøgte blodgrupper har også korrelater hos chimpanser: MNS-blodgruppesystemet (V-A-B-D hos chimpanser) og Ii-blodgruppen (ikke polymorft hos chimpanser).

Genetiske analyser af ABO-blodgruppesystemet har antydet, at de samme antigener er opstået flere gange i løbet af primaternes evolution, og at polymorfismen opretholdes ved en balancerende udvælgelse inden for populationer. Dette kan tyde på, at opretholdelsen af diversitet inden for forskellige blodgruppeantigener er vigtig for, at populationer undgår patogener. Det er blevet påvist, at et stort antal virale og bakterielle patogener binder ABO-typer forskelligt. De pres, der ligger til grund for de forskellige blodgruppeantigener, er imidlertid endnu ikke helt forstået. Uanset dette er blodgruppeantigenerne på trods af deres kliniske betydning ikke nyttige til at forstå menneskets unikke karakter.