Phytol, en C20-alkohol, der foresterer C-173-propionat, og Mg2+-ionen, der er chelateret i det centrale hulrum, er konservative strukturelle bestanddele af klorofyller. For at evaluere deres intramolekylære strukturelle virkninger fremstillede vi en række metal- og fytylfrie derivater af bakterioklorofyl a og anvendte dem som modelklorofyller. En detaljeret spektroskopisk undersøgelse af modelpigmenterne afslører betydningsfulde forskelle i de spektrale karakteristika af de phytylerede og ikke-fytylerede pigmenter. Deres analyse med hensyn til solvatokromisme og aksial koordinering viser, hvordan den centrale Mg- og phytylrest former pigmentets egenskaber. Det er overraskende, at tilstedeværelsen/fraværet af det centrale Mg ikke har nogen effekt på solvatokromismen af (bakterio)klorofyls π-elektronsystem, og at phytyls hydrofobicitet ikke forstyrrer kromoforens første solvationsskal. Begge rester har imidlertid en betydelig indflydelse på konformationen af pigmentets makrocyklus, og fjernelse af en af resterne øger makrocyklussens fleksibilitet. Chelatering af Mg har en udfladende virkning på makrocyklusen, mens den voluminøse phytylrest synes at kontrollere kromoforens konformation via steriske interaktioner med ring V og dens substituenter. Analysen af de spektroskopiske egenskaber af bakteriochlorophyllid (fri syre) viser, at forestering af C-173-propionat er nødvendig i chlorophyller, fordi carboxylgruppen kan fungere som en stærk chelator for den centrale Mg. Disse observationer indebærer, at de afkortede klorofyller, der anvendes i teoretiske undersøgelser, ikke er egnede som modeller for indfødte chromophorer, især når fine effekter skal modelleres.