Der Chapel Rock besteht aus Sandstein aus dem Kambrium, der etwa 500 Millionen Jahre alt ist, und ist das Ergebnis der Erosion, die durch einen proglazialen See verursacht wurde, der etwas verwirrend als “Nipissing Great Lakes” bezeichnet wird. Dieser riesige Wasserkörper bestand aus separaten Becken, die durch Meerengen miteinander verbunden waren, und umfasste einst den heutigen Lake Superior, Lake Huron, Lake Michigan und Georgian Bay. Vor etwa 3.800 Jahren fraß sich das Hochwasser der Nipissing Great Lakes durch den weichen Sandstein und führte zu der heutigen dramatischen Formation, die in den Lake Superior hineinragt.
Obwohl das Gestein des Chapel Rock überwiegend beige ist, ist seine Basis dank der Mineralienkonzentration in einem warmen Orange gehalten. Die Sandsteinfelsen, aus denen die Pictured Rocks bestehen, sind reich an Eisen, Kupfer, Mangan und Limonit, die ihnen rote, orange, blaue, grüne, braune, schwarze und weiße Farbtöne verleihen. Vor nicht allzu langer Zeit überspannte eine natürliche Felsbrücke den Bereich zwischen Chapel Rock und dem Festland. Sie stürzte in den 1940er Jahren ein, so dass die Formation nicht mehr mit dem Rest des Ufers verbunden war. Glücklicherweise ist der Rest der Struktur intakt geblieben und wird auf Anordnung des Lakeshore Superintendent vor Kletterern geschützt.
Der Fels ist nicht das Einzige, was sich als bemerkenswert haltbar erwiesen hat. Charles Penny, ein Mitglied der Douglass-Houghton-Expedition, die das Südufer des Lake Superior erforschte, beschrieb bewundernd eine einzelne Kiefer, die wie eine “Spitze” aus der kargen Erde wuchs, die den Gipfel des Felsens bedeckte. Bis zum heutigen Tag wacht dieselbe unverwüstliche Kiefer über den Chapel Rock, der durch sein ausgedehntes Wurzelsystem mit dem Festland verbunden ist.
Dieser einsame Baum und der Sandsteinvorsprung, auf dem er steht, sind bei den Einheimischen so beliebt, dass der Standort 2018 auf dem US-Viertelschein mit dem Thema Michigan abgebildet wurde, der den Pictured Rocks National Lakeshore repräsentiert.