Este había dado su nombre a la cultura de Este, una cultura protohistórica existente desde finales de la Edad de Bronce italiana (siglos X y IX a.C., fase protovenética) hasta la época romana (siglo I a.C.) y que se ubicaba en el actual territorio del Véneto.

Durante la Edad de Hierro Este fue un importante centro de los venecianos que dejaron una serie de inscripciones en objetos funerarios y votivos.

A finales del siglo III a.C., Este cayó pacíficamente bajo el dominio de Roma y se convirtió en una colonia romana con el nombre de Ateste. Cuando gran parte del norte de Italia obtuvo la ciudadanía romana en el año 49 a.C., los ciudadanos de Este fueron inscritos en la tribu romana de Romilia. Tras la batalla de Actium, el emperador Augusto asentó a los soldados de la Legio V Alaudae y la Legio XI Claudia en el territorio de Este, que comprendía Galzignano Terme, Teolo, Lonigo, Noventa Vicentina, Trecenta, Pernumia, Monselice y Cinto Euganeo.

En la Antigüedad tardía, Este fue devastada y reducida a una aldea rural a causa de las invasiones bárbaras, especialmente la de Atila. Sólo volvió a surgir a partir del siglo X, cuando Azzo II d’Este construyó allí un castillo y se nombró a sí mismo y a su familia, estableciendo la Casa de Este. La Casa de Este mantendría la ciudad hasta 1240, cuando trasladó su capital a Ferrara. Este, por su parte, fue conquistado dos veces por Ezzelino da Romano III, en 1238 y 1249. Fue disputada durante el siglo XIV por los Scaligeri, los Carraresi y los Visconti, hasta que se rindió espontáneamente a Venecia en 1405.

Bajo la República de Venecia, Este atravesó un período de crecimiento económico, interrumpido únicamente por la peste de 1630.

Tras la caída de la República en 1797 y las Guerras Napoleónicas, la ciudad, con toda la región del Véneto, pasó a formar parte del Imperio Austriaco, hasta que fue anexionada por el Reino de Italia como consecuencia de la Tercera Guerra de la Independencia de 1866.