Vertailu selkärankaisten ja niiden selkärangattomien chordat-sukulaisten, cephalochordatien (amphioxus) ja tunikaattien keskushermostojen (CNS:n) välillä on antanut tietoa siitä, miten selkärankaisten CNS kehittyi. Mikroanatomia ja geeniekspressio viittaavat siihen, että esi-isien hermosto oli todennäköisesti samanlainen kuin nykyaikaisen sammakkoeläimen hermosto. Akordiaisten CNS:n evolutiivisesta alkuperästä ei kuitenkaan vallitse yksimielisyyttä. On kiistanalaista, oliko Ambulacraria-eläinten (piikkinahkaiset ja puolisäikeiset) ja jäniseläinten yhteisellä esi-isällä CNS, jossa oli aivot, puolisäikeisten kaltaiset hermosäikeet vai hermoverkko. Jos tällä esi-isällä oli pitkittäinen CNS, jossa oli aivot, se hävisi piikkinahkaisista, jotka kehittivät itsenäisesti viisi sädehermoa. Asian sekoittamiseksi entisestään, hemichordateilla on kaksi hermosäiettä, joissa on vain vähän hermosoluja ja joista puuttuvat aivot. Vaikka konservoitunut geeniekspressio nilviäisissä ja kaksijalkaisissa viittaa siihen, että hermoverkko on CNS:n esi-isä, siitä, oliko kaksijalkaisilla esi-isillä hermoverkko vai hermojohto(t), jolla(i)lla oli erilliset aivot, käydään edelleen kiivasta keskustelua.