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La oposición a Huerta comenzó a surgir una vez que éste asumió el poder. Venustiano Carranza en Coahuila, Villa en Chihuahua y Álvaro Obregón en Sonora formaron un frente contra el dictador bajo el Plan de Guadalupe, emitido en marzo de 1913. Zapata prefirió mantener la independencia de sus tropas de la coalición del norte, pero se mantuvo en rebeldía contra Huerta. Éste respondió aumentando el tamaño del ejército mediante el reclutamiento forzoso. Las fuerzas federales aterrorizaron el campo y saquearon los pueblos, y los asesinatos políticos se convirtieron en una marca del gobierno de Huerta. El país se enfrentaba a otros problemas. El tesoro federal estaba vacío y cada facción comenzó a emitir su propia moneda. El gobierno de Huerta no había sido reconocido por Estados Unidos, que lo consideraba un usurpador del gobierno previamente elegido. Buscando un retorno al gobierno constitucional, la administración del presidente Woodrow Wilson canalizó la ayuda indirectamente a la coalición del norte.
Para principios de 1914, Huerta estaba perdiendo claramente en todos los frentes, pero hubo un evento específico que precipitó su renuncia. Cuando los marineros estadounidenses fueron arrestados en Veracruz por invadir las instalaciones del muelle, el comandante de las fuerzas navales de Estados Unidos frente a Tampico exigió saludos ceremoniales a la bandera de Estados Unidos por parte del personal mexicano. Cuando no se cumplieron las exigencias de Estados Unidos, las tropas estadounidenses ocuparon Veracruz. La indignación provocó una serie de represalias contra los ciudadanos estadounidenses y su bandera en todo México. Ante el creciente desorden, Huerta renunció el 8 de julio de 1914.