Det låter som metatarsalgi för mig. Om du kollar in symtomavsnittet den artikeln så stämmer de överens med det du beskrev. Löpning och hoppning ökar risken för metatarsalgi, och allt som ökar påverkan på fötterna gör det värre. Artikeln listar bärande av skor utan lämplig stoppning som en riskfaktor, så dina vibrams brist på stoppning kan bidra till problemet. Övervikt ökar också påverkan, vilket bidrar till problemet (jag vet inte om detta är ett problem för dig eller inte). Jag kan tänka mig att löpning på underlag med hög slagkraft som betong också skulle öka din risk (gräs och asfalt har mer eftergivenhet).
Att fördela mer vikt på fotbollen gör också att det blir värre. Enligt Arnheims Principles of Athletic Training:
En av orsakerna till metatarsalgi är begränsad töjbarhet hos gastrocnemius-soleus-komplexet. På grund av denna begränsning förkortar idrottaren gångens mittfas och betonar tå-av-fasen, vilket orsakar överdrivet tryck under framfoten.
Översättning: Om vaderna är spända springer du på ett sätt som ger mer tryck på fotbollen. Detta kan vara ett problem för dig. En av fördelarna med barfotalöpning är att det stärker dina fotleder genom att stärka underbensmusklerna som stöder dem. Problemet är att om du inte sträcker dessa muskler regelbundet kan de bli spända. Metatarsalgi kan också orsakas av en nedfallen metatarsalbåge (bågen som går över fotbollen).
Om spända vader misstänks vara bidragande orsaker föreslår Arnheim att man sträcker ut vaderna flera gånger om dagen (se den högra kolumnen i Gastrocnemius- och Soleus-avsnitten på ExRx för några sträckningar). Om du har ett fallande fotvalv orsakat av svaghet bör du också göra fotstärkande övningar. Dessutom föreslår båda de källor som jag nämnde metatarsala kuddar, som sitter bakom fotballen för att hjälpa till med stöd och stötdämpning.