Nil o długości 6 695 km jest jedną z wielkich rzek świata, karmiącą miliony i dającą początek całym cywilizacjom.

Najdalszym źródłem Nilu jest rzeka Ruvyironza, która wpada do Jeziora Wiktorii przez rzeki Ruvubu i Kagera. Inne rzeki wpadające do Jeziora Wiktorii – największego z jezior równikowych Nilu – to Simiyu-Duma, Grumati-Rwana, Mara, Gucha-Migori, Sondu, Yala, Nzoia, Sio, Katonga i Ruizi.

Z Jinja w Ugandzie Biały Nil wypływa z Jeziora Wiktorii jako Nil Wiktorii i płynie na północ, przepływając przez dwa inne jeziora równikowe – Kyoga i Albert. Przez te dwa jeziora Nil uchwycił odpływ z dwóch górzystych i bogatych w opady obszarów (góry Rwenzori i Elgon) na południowo-zachodnich i południowo-wschodnich obrzeżach dorzecza.

Rzeka ponownie wypływa z Jeziora Alberta jako Nil Alberta i podróżuje na północ do Nimule w pobliżu granicy Sudanu Południowego z Ugandą. Z tego miejsca rzeka, znana obecnie jako Bahr el Jebel (czyli rzeka gór), przepływa przez rwące potoki Fula i Sudd, zanim spotka się z Bahr el Ghazal (czyli rzeką gazeli) w jeziorze No. Bahr el Ghazal osusza obszary zachodniego Sudanu Południowego, na których występują duże opady deszczu. Od jeziora No rzeka skręca na wschód, by połączyć się z rzeką Sobat, która niesie wysokie, zmienne sezonowo przepływy pochodzące z Wyżyny Etiopskiej.

Połączone rzeki Bahr el Jebel i Sobat tworzą Nil Biały, który kontynuuje swój bieg na północ i spotyka się z Nilem Błękitnym w Chartumie w Sudanie. Nil Błękitny (znany również jako Abbai lub Abay) bierze swój początek w jeziorze Tana w Etiopii i jest drugim głównym nurtem Nilu. Przed spotkaniem z Nilem Białym, Nil Błękitny jest połączony z kilkoma rzekami, z których główne to Rahad i Dinder, obie pochodzące z Wyżyny Etiopskiej. Od Chartumu połączone rzeki Nilu płyną na północ i łączy je Atbara (Tekezze), również pochodząca z Wyżyny Etiopskiej. Nil Główny płynie dalej na północ i wpływa do jeziora Nasser/Nubia, głównego zbiornika stworzonego przez człowieka na granicy Sudanu i Egiptu, który zapewnia Egiptowi regulację międzyroczną. Nil ostatecznie uchodzi do Morza Śródziemnego poprzez swoją deltę.