Stowarzyszenie Montessori Internationale jest jedyną organizacją Montessori założoną przez samą Montessori. Zostało założone w sierpniu 1929 roku przez Marię i jej syna Mario w Helsingør w Danii, w okresie, w którym doświadczali oni rosnącej wrogości w związku z rozwojem faszyzmu w Niemczech, Włoszech i Hiszpanii. W 1936 roku Montessori przeniosła swoją rodzinę z Barcelony, gdzie mieszkała od 1917 roku, do Laren w Holandii, a biuro AMI do lokalu przy Michelangelostraat w Amsterdamie.
W chwili wybuchu II wojny światowej Montessori była na tournée wykładowym w Indiach wraz z synem Mario i jako obywatele włoscy byli przetrzymywani w areszcie domowym i internowani do końca wojny. Ada Pierson, przyszła żona Mario, utrzymywała AMI w Amsterdamie w czasie wojny, aż do powrotu Marii i Mario w 1947 roku. Tuż przed jej powrotem do Amsterdamu w 1947 r. dom przy Koninginneweg 161 został zakupiony dla niej jako jej dom i biuro dla AMI. Jej gabinet w tym budynku zachował się jako małe muzeum. W okresie powojennym Maria Montessori była szczególnie aktywna w pomaganiu w tworzeniu UNESCO i zaraz po powrocie do Europy w 1947 r. wygłosiła przemówienie do nowo powstałej organizacji na temat “Edukacja i pokój”. Jej ostatnie publiczne zaangażowanie miało miejsce w Londynie w 1951 roku, kiedy uczestniczyła w 9. Międzynarodowym Kongresie Montessori. 6 maja 1952 roku Montessori zmarła, przekazując swoje dziedzictwo w AMI swojemu synowi Mario. AMI została następnie zarejestrowana holenderskim dekretem królewskim w Holandii 24 stycznia 1954 roku jako Internationale Montessori Vereniging (Association Montessori Internationale).
Mario Montessori utrzymał stanowisko Dyrektora Generalnego AMI po śmierci Marii w 1952 roku aż do swojej śmierci w 1982 roku. Ada Montessori Pierson zastąpiła go i objęła funkcję Sekretarza Generalnego AMI aż do swojej śmierci w 1988 roku, po czym Fahmida Malik przejęła tę rolę w organizacji.
W okresie pełnienia funkcji Dyrektora Generalnego AMI Mario Montessori wyznaczył Nancy McCormick Rambusch w 1958 roku do reprezentowania AMI w USA. Rambusch założyła Amerykańskie Stowarzyszenie Montessori we wrześniu 1960 roku.
W 1973 roku, w 75 rocznicę urodzin Mario Montessori, Fundusz Mario Montessori 75 (MM75 Fund), został założony jako fundacja non-profit na jego cześć w celu pomocy w finansowaniu profesjonalnych szkoleń w edukacji Montessori. Fundusz jest administrowany przez AMI.