Phytol, alkohol C20 estryfikujący propionian C-173, oraz jon Mg2+ chelatowany w centralnej wnęce, są konserwatywnymi składnikami strukturalnymi chlorofili. W celu oceny ich wewnątrzcząsteczkowych efektów strukturalnych otrzymaliśmy serię pochodnych bakteriochlorofilu a wolnych od metali i fitylu i zastosowaliśmy je jako chlorofile modelowe. Szczegółowe badania spektroskopowe pigmentów modelowych ujawniły znaczące różnice w charakterystyce spektralnej pigmentów fitylowanych i niefitylowanych. Ich analiza pod względem solwatochromizmu i koordynacji osiowej pokazuje, jak centralna reszta Mg i fitylowa kształtują właściwości pigmentu. Co zaskakuj±ce, obecno¶ć/nieobecno¶ć centralnego Mg nie ma wpływu na solwatochromizm układu π-elektronowego (bakterio)chlorofilu, a hydrofobowo¶ć fitylu nie zaburza pierwszej powłoki solwatacyjnej chromoforu. Jednakże, obie reszty znacząco wpływają na konformację makrocyklu barwnika i usunięcie którejkolwiek z nich zwiększa elastyczność makrocyklu. Chelatowanie Mg wpływa na spłaszczenie makrocyklu, podczas gdy nieporęczna reszta fitylowa wydaje się kontrolować konformację chromoforu poprzez oddziaływania steryczne z pierścieniem V i jego podstawnikami. Analiza właściwości spektroskopowych bakteriochlorofilidu (wolnego kwasu) wskazuje, że estryfikacja propionianu C-173 jest konieczna w chlorofilach, ponieważ grupa karboksylowa może działać jako silny chelator centralnego Mg. Obserwacje te sugeruj±, że okrojone chlorofile używane w badaniach teoretycznych nie s± odpowiednie jako modele rodzimych chromoforów, szczególnie gdy modelowane maj± być efekty drobnoziarniste.